Re: Survival analysis - Coxin yms. regressiomallit

[vastaus aiempaan viestiin]

Kirjoittaja: Reijo Sund
Sähköposti:    reijo.sund'at'stakes.fi
Päiväys: 19.11.2004 12:46

Ehdotin tosiaan taannoin Kim Huuhkolle graduaiheeksi ns.
survival-tree tekniikkaan (CART sensuroidulle aineistolle)
perustuvan analyysimenetelmän implementointia. Kim työstikin
modulin ja sisällytti siihen myös Kaplan-Meier-estimaattorin,
life-table-estimaattorin sekä eloonjäämiskäyrien vertailutestejä.
Dokumentaatio itse modulissa on erittäin pintapuolista, mutta
gradusta löytyy käyttöohje suomeksi. Koitan kirjoitella
jonkumoisen englanninkielisen tiivistelmän oleellisista
jutuista (ja rajoituksista), niin modulia pääsevät muutkin
halukkaat hyödyntämään.

Petrin uumoilu parametristen käyrien sovittamisesta ESTIMATElla
on perustapauksissa helppoa. Olen joskus sovitellut ilman
suurempia ongelmia ainakin eksponentiaalijakaumia ja useamman
eksponenttijakauman sekoituksia. Muistaakseni jossain tapauksissa
erityisesti weibull-käyrien kanssa oli pieniä hankaluuksia pitää
parametreja sallitulla alueella, kun ESTIMATEssa rajoja ei voi
helposti kiinnittää ja ns. "sakkofunktioiden" käyttö saattaa olla
yllättävän työlästä.

Mieleeni ei myöskään ainakaan heti tule mitään periaatteellista
estettä käyttää ESTIMATEa eksponentti- tai weibull-
regressiomallien estimoimiseen. Sen kun vain etsii jostain
(tai johtaa itse) uskottavuusfunktion yhden havainnon
kontribuution ja käyttää sitten ESTIMATEa..

Coxin malli tai frailty-tekijöiden käyttö kuitenkin vaativat
hiukan erikoistuneempia estimointitekniikoita, joten niitä
varten pitäisi tehdä vähän enemmän työtä.

Vastaukset:

Survo-keskustelupalstan (2001-2013) viestit arkistoitiin aika ajoin sukrolla, joka automaattisesti rakensi viesteistä (yli 1600 kpl) HTML-muotoisen sivukokonaisuuden. Vuoden 2013 alusta Survo-keskustelua on jatkettu entistäkin aktiivisemmin osoitteessa forum.survo.fi. Tervetuloa mukaan!

Etusivu  |  Keskustelu
Copyright © Survo Systems 2001-2013. All rights reserved.
Updated 2013-06-15.